Bereits im Jahr 1966 wurde die Gründung einer Wirtschaftshochschule am Standort Klagenfurt geplant, die Entscheidung fiel zuerst aber auf den Schwerpunkt Bildungswissenschaften. Daher ist auch das Geographiestudium, das 1975 eingerichtet wurde, der älteste Studiengang der jetzigen Fakultät für Wirschaftswissenschaften. Im Jahr 1984 wurde den Studierenden erstmals das Studium der "angewandten Betriebswirtschaftslehre" angeboten und ein Jahr später das Institut für Wirtschaftswissenschaften gegründet. Im Jahr 1990 erfolgte die Gründung der Fakultät für Wirtschaftswissenschaften und Informatik. Nach der "Durchwanderung" unterschiedlicher Organisationsformen kam es schließlich im Jahr 2007 zur Gründung einer eigenständigen Fakultät für Wirtschaftswissenschaften.

Die Fakultät für Wirtschaftswissenschaften der Alpen-Adria-Universität Klagenfurt ist in ihrem Bereich die „Angewandte“ unter den österreichischen Fakultäten. Die Kerndisziplin der Fakultät ist die Angewandte Betriebswirtschaftlehre, interdisziplinär verbunden mit anwendungsbezogener Geographie, Rechtswissenschaft, Soziologie und Volkswirtschaftslehre. Die Fakultät setzt sich in diesen Disziplinen Themenschwerpunkte, die sie im Spannungsfeld von Kultur, Wirtschaft und Gesellschaft in Forschung und Entwicklung, Lehre und Beratung vertritt.

Leitgedanke ist stetiges Streben nach wissenschaftlicher Erkenntnis in der Einheit von Forschung, Studium und Lehre. Die Fakultät bekennt sich zu verantwortungsbewusster und kritischer Weltoffenheit, zur Vielfalt wissenschaftlicher Meinungen, zu Interdisziplinarität sowie zum partnerschaftlichen Zusammenwirken von Studierenden und Lehrenden in Forschung, Studium und universitärer Selbstverwaltung. Die übergeordneten Ziele der Fakultät sind, hervorragende Forschungsleistung zu erbringen, hohe Qualität von Studium und Lehre in Grund- und Weiterbildung zu gewährleisten sowie fachliche Impulse zur regionalen und überregionalen Entwicklung zu geben.

Diese Ziele erreicht die Fakultät vor allem durch die Förderung der fachlichen und persönlichen Entwicklung der Fakultätsmitglieder, durch den Vorrang von Qualität der Leistung vor Quantität, durch die aktive Beteiligung in der internationalen wissenschaftlichen Gemeinschaft, durch ökonomischen Umgang mit ihren ideellen und materiellen Ressourcen sowie durch die Zusammenarbeit mit Institutionen in Wirtschaft und Gesellschaft.